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德国大肠杆菌检测试剂盒在深圳研制成功--中国国情
2011-06-08

  深圳新闻网讯  (记者 贾少强 孙中海 通信员 梁淡丽)昨日,华大基因研究院发布最新研究进展,公布了第三版的含有最新测序数据的大肠杆菌基因组完成图谱,并且华大基因与其合作研究小组已研制出该大肠杆菌的诊断试剂盒,将无偿供给检测实验办法细节及所需引物序列信息,给全球范围内的病情诊断、疫情监测和污染源调查供给支撑。

  自5月中旬德国大肠杆菌疫情爆发以来,已对德国的公众健康造成了严重的伤害,疫情也正陆续蔓延至欧洲各地。全球科研工作者们正利用深圳华大基因研究院早前公布的该大肠杆菌基因组序列信息积极的开展研究,为早日停止这场疫情而共同尽力。

  华大基因的研究团队整合了之前发表的Ion Torrent数据和基于Illumina公司Hiseq测序平台新产生的数据,并进行序列拼接,从而得到第一个真正意义上基于从头测序的组装结果。这次新发表的全基因组组装结果,比早前发布的版本更加完全(完全度>99%)并且修正了之前可能涌现的组装错误。对该版本的基因组序列的剖析也同样证实了该大肠杆菌含有来自肠出血性大肠杆菌(EHEC)和肠黏附性大肠杆菌(EAEC)的致病基因。

  基于之前的研究发现,华大基因与军事医学科学院微生物风行病研究所的科研人员敏捷开展了针对该大肠杆菌的诊断试剂盒的研发。并且于昨日验证完成了可快速检测该大肠杆菌菌株的PCR诊断方案。该诊断办法主要通过两对特异性引物的扩增,而鉴定出与黏附性及出血性相干基因结合。该办法可在收到样品后2~3小时内供给诊断结果,其对疫情监控和和致病病菌的检测起侧重要作用。

  华大基因对试剂盒的敏锐度和特异性进行数据剖析及实验测试,证明了该检测方案具有高度特异性。敏锐度实验检测结果也表明,该办法在DNA浓度低至约1皮克(10~12克)的反响体系中仍可检测出该菌株。更多的验证试验将会在本周继续开展。同时,为了更好地掌握此疫情的传播,华大基因与军事医学科学院微生物风行病研究所将免费为全球疾病掌握和研究机构供给合成引物,为监控及预防全球范围内疫情的扩散供给辅助。

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